A COVID-19 mutáns törzs „négy királya”.

Az új koronajárvány globális világjárványa óriási veszteségeket okozott, és hatással van a globális gazdasági növekedésre, a kulturális cserékre és az emberek mindennapi életére szerte a világon. Mindeddig, bár a globális járvány kialakulását hatékonyan sikerült megelőzni és ellenőrizni. A mutációval azonban aCOVID 19, egyes országokban mutáns törzsek jelentek meg, amelyek gyorsabban terjednek. Közülük az Egyesült Királyságban, Dél-Afrikában, Brazíliában, Indiában stb. előfordult új koronavírus-változatok a mutáns törzsek „négy királyának” nevezhetők.

• Az Alpha 2020 szeptemberében jelent meg Angliában, és a téli esetek megugrását idézte elő, így az Egyesült Királyságot januárban újra bezárták. Más országok szorosan le vannak maradva, különösen Európában. Az Egészségügyi Világszervezet szerint április elején ez lett a domináns törzs az Egyesült Államokban, május 25-ig pedig legalább 149 ország jelentette ezt a törzset.
• A béta 2020 augusztusában jelent meg Dél-Afrikában, ami a Covid-19 esetek visszatéréséhez vezetett, és elsöprő volt Dél-Afrikában. Május 25-ig legalább 102 ország jelentette ezt a helyzetet.
• A gammát először 2020 decemberében fedezték fel Manaus Amazonas városában, ami megugrott az esetek számában, megterhelte Brazília egészségügyi rendszerét és oxigénhiányt okozott. Május 25-ig legalább 59 ország jelentette ezt a helyzetet.
• A Deltát először 2020 októberében fedezték fel Indiában, május végén pedig legalább 54 országban találták meg a vírust. A brit Emergency Science Advisory Group május 13-án kijelentette, hogy átviteli sebessége 50%-kal nagyobb lehet, mint az alfa változaté.

A 2019-nCoV a koronavírusok béta nemzetségébe tartozik. Ez egy egyszálú pozitív szálú RNS vírus burokkal. A részecskék kerekek vagy elliptikusak, átmérőjük 60-140 nm. 5 esszenciális génje van, amelyek rendre 4 szerkezeti fehérjét kódolnakNukleokapszid fehérje (N),Burkolj fehérjét (E),Membrán fehérje (M) ésScsukaGlikoprotein (S), ésHemagglutinin-észteráz-dimer (RdRp). ANukleokapszid fehérje (N) beburkolja az RNS genomot, hogy stabil nukleokapszidot képezzen. A nukleokapszidot vírusburok (E) veszi körül a védelem érdekében. A vírusborítékban vannakMembrán fehérje (M) ésScsukaGlikoprotein (S) Egyenlő fehérje. Közülük az új koronavírus a felszíni tüskeprotein segítségével kötődik a sejtreceptorokhoz, majd megtámadja a sejteket. A Spike Glycoprotein szintén fontos struktúra az immunrendszer számára, hogy felismerje a vírusokat és ellenanyagokkal semlegesítse azokat. Ez a négy új koronavírus-mutáns törzs pontosan a Spike Glycoprotein (S) kulcsfontosságú helyeinek mutációinak köszönhető, ami jelentős változásokhoz vezet a mutáns törzsek sejtreceptorokhoz vagy semlegesítő antitestekhez való affinitásához. Ez tovább vezetett ahhoz, hogy ez a négy mutáns törzs vált a jelenleg keringő fő törzsté.

Az alfa és béta mutáns S fehérjék főbb jellemzői a következők:

A Chen Bing professzor, a Harvard Medical School és a Boston Children’s Hospital munkatársa által vezetett csapat a közelmúltban egy sor kutatási eredményt publikált a „Science” című tudományos folyóiratban, amelyek kimutatták, hogy először az alfa-változatban fedezték fel. Az A570D és S982A aminosavcserék segítik a tüskeprotein trimert abban, hogy a receptorkötő doménjét olyan helyzetben tartsák, ahol a receptorhoz kötődnek. Ugyanakkor az N501Y növeli a receptorkötő domén kötődési affinitását az ACE2 receptorhoz. A kutatók azt feltételezik, hogy ezek a változások lehetővé tehetik az alfa-variánsok számára, hogy megfertőzzék azokat a sejttípusokat, amelyek kevesebb ACE2-receptorral rendelkeznek.

A csapat kutatási eredményei azt is mutatják, hogy a Beta vírusban az S fehérje nagyrészt megőrzi a G614 trimer szerkezetét, és szinte azonos biokémiai stabilitással rendelkezik. Az N501Y, K417N és E484K az RBD-ben nem okozott jelentősebb szerkezeti változásokat, de a K417 és az ACE2 Asp30, valamint a Glu484 és ACE2 Lys31 közötti sóhidak elvesztése enyhítette az N501Y által biztosított receptoraffinitás növekedését. A K417N és az E484K azt okozhatja, hogy az RBD-2 epitópot megcélzó antitestek elveszítik a kötődést és a semlegesítést. Az NTD kísérő mutációi átformálják az antigén felszínét, és nagymértékben csökkentik az NTD-1 epitóp elleni semlegesítő antitestek hatékonyságát. A béta-variánsokat valószínűleg bizonyos fokú immunnyomás alatt választják ki

A Gamma mutáns S fehérje fő jellemzői:

A Science folyóiratban 2021. április 14-én megjelent tanulmányban egy nemzetközi kutatócsoport kapcsolódó kutatásokat és elemzéseket végzett a Gamma (P.1) új koronavírus-változatairól, amelyek Brazíliában jelentek meg. Az eredmények azt mutatják, hogy a Gamma (P.1) vírus 17 egyedi aminosav változást tartalmaz, amelyek közül 10 van jelen a tüskeproteinben, köztük a három legaggasztóbb változat: N501Y, E484K és K417T. Az N501Y és a K417T kölcsönhatásba lép a humán angiotenzin-konvertáló enzim 2-vel (ACE2), míg az E484K az emberi ACE2 interfészen kívüli hurokterületen található. Érdemes megjegyezni, hogy ez a három változat létezik a nagy figyelmet kapott dél-afrikai változatban (Béta, B.1.351), az N501Y pedig a brit változatban (Alpha, B.1.1.7). Mivel úgy tűnik, hogy a vírusváltozatot erősebben kötik az emberi sejtekhez, bizonyos esetekben azért, hogy segítsenek elkerülni az antitesteket.

A Delta mutáns S fehérje fő jellemzői:

A bioRxiv platformon 2021. június 17-én megjelent cikk megállapította, hogy a delta (B.1.617) variánsok tanulmányozása révén a P681R mutáció erősen konzervált a delta (B.1.617) vonalban. Mélyreható kutatások során kiderült, hogy a P681R mutációja elősegítette a tüskefehérje furin által közvetített hasítását és felgyorsította a sejt-sejt fúziót. És elősegíti a P681 mutációt, hogy fokozza a vírus azon képességét, hogy elkerülje a semlegesítő antitesteket.

A „négy király” járványtani és etiológiai jellemzői szerintCOVID 19 mutáns törzs, látható, hogy a járvány lokális járványa a globális járvány normális állapota lesz. A nemzetközi járványmegelőzési politikára való aktív reagálás és egy széles spektrumú és hatékony új koronavakcina keresése a járvány elleni hatékony fegyverünkké válik.

(Adatforrás: WHO)