"Papat Raja" saka galur mutan COVID-19

Pandemi global wabah mahkota anyar wis nyebabake kerugian lan pengaruh gedhe marang pertumbuhan ekonomi global, ijol-ijolan budaya lan urip saben dinane wong ing saindenging jagad. Nganti saiki, sanajan pangembangan epidemi global wis dicegah lan dikontrol kanthi efektif. Nanging, karo mutasi sakaCOVID 19, sawetara negara wis muncul galur mutated sing nyebar luwih cepet. Ing antarane, varian koronavirus anyar sing kedadeyan ing Inggris, Afrika Kidul, Brasil, India, lan sapiturute bisa diarani minangka "papat raja" saka galur mutan.

• Alpha muncul ing Inggris ing September 2020 lan nyebabake lonjakan ing kasus musim dingin, nggawa Inggris bali menyang kunci ing Januari. Negara liya cedhak, utamane ing Eropa. Miturut Organisasi Kesehatan Dunia, iki dadi galur dominan ing Amerika Serikat ing awal April, lan tanggal 25 Mei, paling ora 149 negara wis nglaporake galur iki.
• Beta muncul ing Afrika Kidul ing wulan Agustus 2020, nyebabake kasus Covid-19 bali maneh, nyapu Afrika kidul. Ing tanggal 25 Mei, paling ora 102 negara wis nglaporake kahanan iki.
• Gamma pisanan ditemokake ing kutha Manaus ing Amazon ing Desember 2020, nyebabake lonjakan kasus, nyebabake sistem kesehatan Brasil lan nyebabake kekurangan oksigen. Ing tanggal 25 Mei, paling ora 59 negara wis nglaporake kahanan kasebut.
• Delta pisanan ditemokake ing India ing Oktober 2020, lan ing pungkasan Mei, virus kasebut wis ditemokake ing paling ora 54 negara. Grup Penasihat Ilmu Darurat Inggris nyatakake tanggal 13 Mei manawa tingkat transmisi bisa 50% luwih dhuwur tinimbang varian alpha.

2019-nCoV kalebu genus beta saka coronavirus. Iki minangka virus RNA untaian positif tunggal kanthi amplop. Partikel kasebut bunder utawa elips lan duwe diameter 60-140nm. Wis 5 gen penting, kang mungguh encode 4 protein struktural sakaProtein nukleokapsid (N),Envelope protein (E),Membrane protein (M) lanSpikeGlikoprotein (S), lanHemagglutinin-esterasedimer (RdRp). IngProtein nukleokapsid (N) mbungkus genom RNA kanggo mbentuk nukleokapsid stabil. Nukleokapsid diubengi dening amplop virus (E) kanggo perlindungan. Ing amplop virus, anaMembrane protein (M) lanSpikeGlikoprotein (S) Protein sing padha. Ing antarane, koronavirus anyar nggunakake protein spike permukaan kanggo ikatan karo reseptor sel, banjur nyerang sel. Spike Glycoprotein uga minangka struktur penting kanggo sistem kekebalan kanggo ngenali virus lan netralake karo antibodi. Papat galur mutan koronavirus anyar iki amarga mutasi ing sawetara situs utama Spike Glycoprotein (S), sing nyebabake owah-owahan sing signifikan ing afinitas galur mutan karo reseptor sel utawa antibodi netralake. Iki luwih nyebabake papat galur mutan iki dadi galur utama sing saiki beredar.

Karakteristik utama protein S mutan Alpha lan Beta yaiku:

Tim sing dipimpin dening Profesor Chen Bing saka Sekolah Kedokteran Harvard lan Rumah Sakit Anak Boston bubar nerbitake seri asil riset ing jurnal akademik paling dhuwur "Ilmu", nuduhake yen pisanan ditemokake ing varian alpha. Asam amino ngganti A570D lan S982A mbantu trimer protein spike supaya domain naleni reseptor ing posisi sing ikatan karo reseptor. Ing wektu sing padha, N501Y nambah afinitas ikatan domain pengikat reseptor menyang reseptor ACE2. Peneliti spekulasi manawa owah-owahan kasebut bisa ngidini varian alpha nginfeksi jinis sel sing duwe reseptor ACE2 luwih sithik.

Asil riset tim uga nuduhake yen ing virus Beta, protein S umume nahan struktur trimer G614 lan duwe stabilitas biokimia sing meh padha. N501Y, K417N lan E484K ing RBD ora nyebabake owah-owahan struktural utama, nanging ilang jembatan uyah antarane K417 lan ACE2 Asp30 lan Glu484 lan ACE2 Lys31 nyuda paningkatan afinitas reseptor sing diwenehake dening N501Y. K417N lan E484K bisa nyebabake antibodi sing nargetake epitope RBD-2 ilang ikatan lan netralisasi. Mutasi sing ana ing NTD mbentuk maneh permukaan antigen lan nyuda efektifitas netralake antibodi marang epitope NTD-1. Varian beta bisa uga dipilih miturut tekanan kekebalan tartamtu

Fitur utama protein Gamma mutant S:

Ing panaliten sing diterbitake ing jurnal Science tanggal 14 April 2021, tim peneliti internasional nindakake riset lan analisis sing gegandhengan babagan varian koronavirus anyar Gamma (P.1) sing muncul ing Brasil. Asil kasebut nuduhake yen virus Gamma (P.1) nduweni 17 owah-owahan asam amino sing unik, 10 ing antarané ana ing protein spike, kalebu telung varian sing paling kuwatir: N501Y, E484K, lan K417T. N501Y lan K417T sesambungan karo enzim konversi angiotensin manungsa 2 (ACE2), nalika E484K dumunung ing area loop ing njaba antarmuka ACE2 manungsa. Wigati dicathet menawa telung varian iki uga ana ing varian Afrika Kidul (Beta, B.1.351) sing wis entuk akeh perhatian, lan N501Y ana ing varian Inggris (Alpha, B.1.1.7). Amarga koyone nggawe varian virus ikatan luwih rapet karo sel manungsa, ing sawetara kasus, kanggo mbantu nyingkiri antibodi.

Fitur utama protein Delta mutant S:

Artikel sing diterbitake ing platform bioRxiv tanggal 17 Juni 2021 nemtokake manawa mutasi P681R dijaga banget ing garis keturunan delta (B.1.617) liwat sinau babagan varian delta (B.1.617). Liwat riset sing jero, ditemokake yen mutasi P681R ningkatake pembelahan protein spike sing dimediasi furin lan fusi sel-sel sing cepet. Lan promosi mutasi P681 kanggo nambah kemampuan virus kanggo uwal saka antibodi netralisasi.

Miturut karakteristik epidemiologis lan etiologis saka "papat raja" sakaCOVID 19 galur mutant, bisa dideleng manawa epidemi lokal epidemi bakal dadi kahanan normal epidemi global. Aktif nanggapi kabijakan pencegahan epidemi internasional lan golek vaksin mahkota anyar sing spektrum sing amba lan efektif bakal dadi gaman kuat kanggo nglawan wabah kasebut.

(Sumber data: WHO)